Prema istraživačima sa švicarskog agrikulturnog centra Agroscope, rupe u siru poput Emmentala i Appenzella nastaju zbog sijena prisutnog u mlijeku od kojeg se sir radi. U seriji testova, istraživači su dodavanjem različitih količina sijena otkrili kako na taj način mogu kontrolirati broj rupa u siru. Isto je istraživanje pokazalo i zašto se broj rupa smanjuje tijekom proteklih petnaestak godina – sve suvremenije tehnike mužnje krava smanjuju mogućnost pojave sijena u mlijeku.
Jednostavnim rječnikom, nestankom tradicionalne (ručne) mužnje, nestaje i specifičnost s kojom se švicarski sir proslavio i brandirao. Ono što je također zanimljivo, pojava rupa u siru predmet je istraživanja znanstvenika još od daleke 1917.
